El 28 de Octubre de 1938 se coloca la piedra fundacional del pabellón a construirse en un predio de 9 hás. cedido por la Intendencia Municipal, acontecimiento al cual concurren autoridades nacionales y departamentales.​

Así nace la Escuela Agraria Industrial sin  aún contar con cursos regulares.​

En el año 1945 se inician cursos regulares agrarios en régimen de internado en forma experimental.​
El 28 de marzo de 1948  se separan ambas Escuelas: Agraria-Industrial siendo su primer Director el Ingeniero Agrónomo Alcides Fidel Pintos Techera, y  a partir de 1980 ésta lleva su nombre.​

Desde entonces han pasado como directores: Ing. Agr. .Julio César Colombo, Ing. Agr. Luis Alberto Paiva Osorio, Ing. Agr. Hugo Eduardo Matteo Lucas, Ing. Agr. Ángel Yerú Pardiñas Salomón, Ing. Agr. Walter Vladislavich Osorio, Ing. Agr. Eduardo Correa, Ing. Agr. Flavio Ferreira Márquez, Ing. Agr. Pablo Fratti Ubilla, Prof. Adsc. Nelly Edhit Acosta y en el momento al frente de la Gestión está la Dra. Vet. Lucy Díaz Giménez.

Los cursos dictados a partir de entonces han sido directamente relacionados con la actividad agropecuaria como: Experto Agrario, Perito Agrónomo, Práctico Granjero, Técnico Granjero, en la última década Ciclo Básico Agrario y a partir de la reforma desde el año 2007 la escuela cuenta con el Ciclo Básico Agrario en la Modalidad Alternancia, EMT Agrario, y Curso de Nivel Terciario en orientación Agrícola Ganadera.